Содержимое раздела
В этом разделе будут рассмотрены основные принципы молекулярной динамики, включая уравнения движения Ньютона для классических частиц, межатомные потенциалы и методы интегрирования уравнений движения. Рассматриваются различные типы межатомных потенциалов, такие как потенциал Леннард-Джонса, потенциал Морзе и потенциалы на основе теории функционала плотности. Обсуждаются алгоритмы интегрирования уравнений движения, такие как алгоритм Верле и алгоритм leap-frog. Представлен анализ влияния различных параметров моделирования на точность и надежность результатов.