Во введении объясняется, почему реки Томска и Томской области рассматриваются как единая экологическая система, связанная с бассейном Томи. Обозначаются объект и предмет проекта, основные вопросы исследования, предполагаемые источники информации и значение участия школьников в наблюдении за состоянием местных водоёмов.

Пункт знакомит с Томью, Ушайкой, Басандайкой, Киргизкой и Кисловкой, их расположением, связями с бассейном Оби и значением для городской и природной среды. Отдельно рассматриваются особенности крупных и малых рек, берегов, пойм, мест отдыха и участков, наиболее чувствительных к хозяйственной нагрузке.

Здесь систематизируются источники загрязнения: коммунальные и промышленные стоки, ливневый смыв с дорог, бытовой мусор, нефтепродукты, сельскохозяйственные вещества и разрушение берегов. Для каждого фактора показывается путь попадания загрязнителя в воду и объясняется, почему его воздействие различается у Томи и малых притоков.

В разделе раскрывается, как загрязнение меняет прозрачность, запах, химический состав и содержание кислорода в воде. Рассматриваются эвтрофикация, заморы, накопление токсичных веществ, ухудшение нерестилищ, разрушение берегов, снижение рекреационной ценности рек и возможные риски при контакте человека с загрязнённой водой.

Пункт посвящён видам, которые особенно зависят от чистой воды, сохранных берегов, нерестилищ и кормовой базы. Объясняется, почему нельзя объявлять вид вымирающим только по одному наблюдению, как отличать подтверждённые сведения от предположений и почему для Томской области необходимо обращаться к региональной Красной книге.

Описывается безопасная методика школьных наблюдений: выбор участков, фотофиксация, заполнение полевого дневника, оценка мусора, состояния берегов, запаха, цвета и прозрачности воды без контакта с неизвестными веществами. Полученные сведения сравниваются с официальными данными, картами и публикациями, а ограничения метода указываются отдельно.

В разделе формулируются конкретные действия для школьников, жителей, организаций и участников субботников: правильное обращение с отходами, защита прибрежной растительности, отказ от опасных сбросов, безопасная уборка и фиксация нарушений. Рекомендации распределяются по уровням ответственности и сопровождаются объяснением ожидаемого экологического эффекта.

Пункт показывает, как представить проблему без запугивания и недостоверных утверждений. Предлагаются школьная памятка, карта наблюдений, плакаты, короткие сообщения для социальных сетей и сценарий классного мероприятия, где жители узнают признаки загрязнения, правила поведения у воды и официальные способы передачи обращений.

В заключении обобщаются результаты изучения пяти рек, сопоставляются основные факторы загрязнения и экологические последствия, оценивается подтверждение поставленных задач. Отдельно показывается практическая ценность разработанных рекомендаций, возможные ограничения школьного исследования и направления дальнейшего наблюдения за состоянием водоёмов.

В список включаются официальные материалы о состоянии окружающей среды Томской области, региональные документы по охране водных объектов, научные и учебные издания по гидрологии и экологии, сведения о Красной книге, картографические ресурсы и источники фотографий. Для каждого электронного ресурса указываются название, организация и дата обращения.